دانلود مقاله ISI انگلیسی شماره 79074
عنوان فارسی مقاله

بررسی الگوریتم های خوشه بندی برای کشف سایت الزام آور فاکتور رونویسی بدون نظارت

کد مقاله سال انتشار مقاله انگلیسی ترجمه فارسی تعداد کلمات
79074 2011 7 صفحه PDF سفارش دهید محاسبه نشده
خرید مقاله
پس از پرداخت، فوراً می توانید مقاله را دانلود فرمایید.
عنوان انگلیسی
Assessment of clustering algorithms for unsupervised transcription factor binding site discovery
منبع

Publisher : Elsevier - Science Direct (الزویر - ساینس دایرکت)

Journal : Expert Systems with Applications, Volume 38, Issue 9, September 2011, Pages 11160–11166

کلمات کلیدی
یافته Motif؛ خوشه بندی؛ مقایسه؛ فاکتور رونویسی؛ فراگیری ماشین
پیش نمایش مقاله
پیش نمایش مقاله بررسی الگوریتم های خوشه بندی برای کشف سایت الزام آور فاکتور رونویسی بدون نظارت

چکیده انگلیسی

Identification of transcription factor binding sites is a key task to understand gene regulation mechanism to discover gene networks and functions. Clustering approach is proved to be useful when finding such patterns residing in promoter regions of co-regulated genes. Four clustering algorithms, Self-Organizing Map, K-Means, Fuzzy C-Means and Expectation-Maximization are studied in this paper to discover motifs in datasets extracted from Saccharomyces cerevisiae, Escherichia coli, Droshophila melanogaster and Homo sapiens DNA sequences. Required modifications to clustering algorithms in order to adapt them to motif finding task are presented through the paper. Then, their motif-finding performances are discussed carefully and evaluated against a popular motif-finding method, MEME.

خرید مقاله
پس از پرداخت، فوراً می توانید مقاله را دانلود فرمایید.