دانلود مقاله ISI انگلیسی شماره 108318
ترجمه فارسی عنوان مقاله

تسهیل تجدید پذیری جریان های علمی با مشخصات محیط اجرایی

عنوان انگلیسی
Facilitating the Reproducibility of Scientific Workflows with Execution Environment Specifications
کد مقاله سال انتشار تعداد صفحات مقاله انگلیسی
108318 2017 10 صفحه PDF
منبع

Publisher : Elsevier - Science Direct (الزویر - ساینس دایرکت)

Journal : Procedia Computer Science, Volume 108, 2017, Pages 705-714

ترجمه کلمات کلیدی
تحقیق قابل تجدید، جریان کار علمی، مشخصات محیط اجرای،
کلمات کلیدی انگلیسی
reproducible research; scientific workflows; execution environment specifications;
پیش نمایش مقاله
پیش نمایش مقاله  تسهیل تجدید پذیری جریان های علمی با مشخصات محیط اجرایی

چکیده انگلیسی

To evaluate our framework, we use it to run two bioinformatics scientific workflows, BLAST and BWA. The execution environment of the tasks in each workflow is specified as an Umbrella specification file, and sent to execution nodes where Umbrella is used to create the specified environment for running the tasks. For each workflow we evaluate the size of the Umbrella specification file, the time and space overheads of creating execution environments using Umbrella, and the heterogeneity of execution nodes contributing to each workflow. The evaluation results show that our framework improves the utilization of heterogeneous computing resources, and improves the portability and reproducibility of scientific workflows.