دانلود مقاله ISI انگلیسی شماره 79011
ترجمه فارسی عنوان مقاله

piClust: یک الگوریتم خوشه بندی piRNA بر اساس تراکم

عنوان انگلیسی
piClust: A density based piRNA clustering algorithm
کد مقاله سال انتشار تعداد صفحات مقاله انگلیسی ترجمه فارسی
79011 2014 8 صفحه PDF سفارش دهید
دانلود فوری مقاله + سفارش ترجمه

نسخه انگلیسی مقاله همین الان قابل دانلود است.

هزینه ترجمه مقاله بر اساس تعداد کلمات مقاله انگلیسی محاسبه می شود.

این مقاله تقریباً شامل 5393 کلمه می باشد.

هزینه ترجمه مقاله توسط مترجمان با تجربه، طبق جدول زیر محاسبه می شود:

شرح تعرفه ترجمه زمان تحویل جمع هزینه
ترجمه تخصصی - سرعت عادی هر کلمه 18 تومان 9 روز بعد از پرداخت 97,074 تومان
ترجمه تخصصی - سرعت فوری هر کلمه 36 تومان 5 روز بعد از پرداخت 194,148 تومان
پس از پرداخت، فوراً می توانید مقاله را دانلود فرمایید.
تولید محتوا برای سایت شما
پایگاه ISIArticles آمادگی دارد با همکاری مجموعه «شهر محتوا» با بهره گیری از منابع معتبر علمی، برای کتاب، سایت، وبلاگ، نشریه و سایر رسانه های شما، به زبان فارسی «تولید محتوا» نماید.
  • تولید محتوا با مقالات ISI برای سایت یا وبلاگ شما
  • تولید محتوا با مقالات ISI برای کتاب شما
  • تولید محتوا با مقالات ISI برای نشریه یا رسانه شما
  • و...

پیشنهاد می کنیم کیفیت محتوای سایت خود را با استفاده از منابع علمی، افزایش دهید.

سفارش تولید محتوا کد تخفیف 10 درصدی: isiArticles
منبع

Publisher : Elsevier - Science Direct (الزویر - ساینس دایرکت)

Journal : Computational Biology and Chemistry, Volume 50, June 2014, Pages 60–67

ترجمه کلمات کلیدی
piRNA؛ PIWI؛ خوشه بندی؛ RNA-seq؛ Genome
کلمات کلیدی انگلیسی
piRNA; PIWI; Clustering; RNA-seq; Genome
پیش نمایش مقاله
پیش نمایش مقاله piClust: یک الگوریتم خوشه بندی piRNA بر اساس تراکم

چکیده انگلیسی

Piwi-interacting RNAs (piRNAs) are recently discovered, endogenous small non-coding RNAs. piRNAs protect the genome from invasive transposable elements (TE) and sustain integrity of the genome in germ cell lineages. Small RNA-sequencing data can be used to detect piRNA activations in a cell under a specific condition. However, identification of cell specific piRNA activations requires sophisticated computational methods. As of now, there is only one computational method, proTRAC, to locate activated piRNAs from the sequencing data. proTRAC detects piRNA clusters based on a probabilistic analysis with assumption of a uniform distribution. Unfortunately, we were not able to locate activated piRNAs from our proprietary sequencing data in chicken germ cells using proTRAC. With a careful investigation on data sets, we found that a uniform or any statistical distribution for detecting piRNA clusters may not be assumed. Furthermore, small RNA-seq data contains many different types of RNAs which was not carefully taken into account in previous studies. To improve piRNA cluster identification, we developed piClust that uses a density based clustering approach without assumption of any parametric distribution. In previous studies, it is known that piRNAs exhibit a strong tendency of forming piRNA clusters in syntenic regions of the genome. Thus, the density based clustering approach is effective and robust to the existence of non-piRNAs or noise in the data. In experiments with piRNA data from human, mouse, rat and chicken, piClust was able to detect piRNA clusters from total small RNA-seq data from germ cell lines, while proTRAC was not successful. piClust outperformed proTRAC in terms of sensitivity and running time (up to 200 folds). piClust is currently available as a web service at http://epigenomics.snu.ac.kr/piclustweb.

دانلود فوری مقاله + سفارش ترجمه

نسخه انگلیسی مقاله همین الان قابل دانلود است.

هزینه ترجمه مقاله بر اساس تعداد کلمات مقاله انگلیسی محاسبه می شود.

این مقاله شامل 5393 کلمه می باشد.

هزینه ترجمه مقاله توسط مترجمان با تجربه، طبق جدول زیر محاسبه می شود:

شرح تعرفه ترجمه زمان تحویل جمع هزینه
ترجمه تخصصی - سرعت عادی هر کلمه 18 تومان 9 روز بعد از پرداخت 97,074 تومان
ترجمه تخصصی - سرعت فوری هر کلمه 36 تومان 5 روز بعد از پرداخت 194,148 تومان
پس از پرداخت، فوراً می توانید مقاله را دانلود فرمایید.